Setelah sibuk membantu kepolisian New York, Peter Parker (Tom Holland) memutuskan tidak membawa kostumnya saat ia melakukan perjalanan dengan teman-teman sekolahnya, MJ (Zendaya), Ned (Jacob Batalon), Betty (Beras Angourie) dan Flash (Tony Revolori). Namun ancaman datang dalam bentuk yang berbeda, teror mulai menyerang kota-kota di Eropa. Kemunculan sosok Mysterio (Jake Gyllenhaal), Nick Fury (Samuel L. Jackson) dan Happy Hogan (Jon Favreau) akan memberi petunjuk dan tugas baru untuk sang manusia laba-laba itu.